福建医科大学创建于1937年，是我国建校较早的公立本科医学院校之一,是一所以医为主，多学科协调发展，具有完整人才培养体系的福建省“双一流”建设高校，是福建省人民政府和国家卫生健康委员会共建高校，是福建省卫生人才培养中心、医学科学研究中心和医疗卫生服务中心。学校荣获第二届全国文明校园称号。

学校现有旗山、乌山2个校区，规划占地约1480亩，有教职医护员工15901人（含附属医院），在校全日制学生19000多人。专任教师（含临床教师）1663人，其中具有博士学位教师占58.87%，具有高级职称教师占69.51%。拥有国家级高层次人才57人次、“南丁格尔”奖章获得者2人、历年享受国务院特殊津贴专家126人，国家级教学团队和全国高校黄大年式教师团队3个；有国家级特色专业4个，国家级一流本科专业建设点11个；有博士学位授权一级学科6个、博士专业学位授权点3个、硕士学位授权一级学科9个、硕士专业学位授权点10个；有临床医学、基础医学、公共卫生与预防医学、药学4个博士后科研流动站，4个博士后工作站，2个院士工作站。临床医学、药理学与毒理学、化学、神经科学与行为学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学、免疫学、材料科学、社会科学总论学科等9个学科进入ESI全球排名前1%。现有临床医学、基础医学等省级一流学科6个。

学校拥有附属协和医院、附属第一医院、附属第二医院、附属口腔医院4所直属附属医院。拥有协和临床医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、省立临床医学院、福总临床医学院、妇儿临床医学院、肿瘤临床医学院、宁德临床医学院等8所临床医学院，在福建省设有10所非直属附属医院，28所临床教学医院，3个非直属附属疾控中心及108个专业实践教学基地。附属医院中拥有神经内科、血液内科、心脏大血管外科、普通外科等国家临床重点专科23个，省级临床重点专科72个。附属第一医院与复旦大学附属华山医院共建的复旦大学附属华山医院福建医院（福建医科大学附属第一医院滨海院区）为全国首批国家区域医疗中心，附属协和医院为综合类国家区域医疗中心牵头建设单位，附属第二医院为首批省级区域医疗中心，附属口腔医院为专科类国家区域医疗中心依托建设单位。